在最初，Camelot只计划将《黄金太阳》设计成一部而非系列，在最早期的设计文件中，游戏预定发布于任天堂平台，但随着N被任天堂GameCube取代的迹象出现，Camelot便转而将精力投向掌机Game Boy Advance平台。

《开启的封印》的开发周期为12－18个月，这段时间对于开发掌机游戏可以说很长了，故而有人认为这是慢工出细活的“证明”。在2000年8月日本举办的任天堂博览会上曾展出过一个《黄金太阳》试玩版。北美玩家在美版发布几周前就收到了游戏，IGN评论道：为世嘉开发光明系列的经验帮助Camelot开发了一款精彩的掌机RPG。

《失落的时代》日版发行于2002年，《Fami通》杂志首先对游戏做出了评论。玩家对本作的发布高度期待，游戏排在了IGN 2003年度“最期待”GBA游戏的榜首。北美版曾在2002年E3游戏展上展出，IGN评论道：本作序章的对话不再像《开启的封印》一样枯燥，而是在动作过程中介绍人物。GameSpot于2003年2月展示过一个英文化版，并评论道：游戏使用了前作的图像引擎，环境内容丰富，精细入微，例如鸟儿会在你靠近时飞走。

《漆黑的黎明》最初由任天堂北美总裁雷吉·菲尔斯-埃米在2009年的任天堂E3游戏展上提及，称系列“曾在六年前走向黑暗，但现在将于任天堂DS平台重新登陆”。

在2012年6月Nintendo Gamer的采访中，游戏制作人高桥宏之表示：“我们制作RPG的一个重大原因就是来自喜欢我们RPG玩家的请求。若有足够的任天堂玩家希望我们制作另一部黄金太阳游戏，那我们就会再开发一作的。” 主条目：黄金太阳角色列表

玩家在《开启的封印》中可以控制四位角色，而在《失落的时代》的剧情过后可以控制八位。在前两作中，罗宾是来自海迪亚村的17岁地元素使，在首作中是一名沉默的队长。杰拉德是17岁的海迪亚村火元素使，虽然身体强壮，但做事常有些不经大脑；尽管如此，他依然是罗宾的亲密战友。伊万是15岁的风元素使，虽然一直和卡莱伊的名商生活在一起，但他真正的家乡实际上是阿缇卡大陆的基亚那，聪颖的他有着敏锐的洞察力。米雅莉是来自永冬之村伊米尔的17岁水元素使，传承了玛求里一组的血统，性格文静的她擅于治疗。加西亚在《开启的封印》中是一个反派角色，但在《失落的时代》中成为了主角，他的妹妹加丝敏是17岁的火元素使，和哥哥一样来自海迪亚。在第一作中，大反派萨帝罗斯与梅娜蒂劫持了加西亚、加丝敏、14岁的风元素使西芭和睿智的老学者斯库莱塔。在第二作中，反派角色则是喀斯特与阿加迪奥。 此外，在两代都有出现的一个浮动的大眼球被称为“贤者”，它可能帮助了这些英雄们开启了炼金术的新时代。

在《漆黑的黎明》中，玩家一共可以控制8名角色。队长地元素使穆特是罗宾与加丝敏的儿子，少言但却有着坚定的意志。特里火使特里是杰拉德的儿子，虽因恶作剧而被反感，但依然穆特的好朋友。风使卡莉丝是伊万的女儿，经常来监视小屋找穆特和特里玩。克劳恩是米雅莉的儿子，一直和师傅斯库莱塔在世界中旅行。哈尔玛尼是阿雅塔由的王子，有着谜一般的身世。兽人元素使史黛拉是摩尔格尔国王的妹妹，有着超越人类的感官，在战斗中可以化身野兽。火元素使雷奥雷奥是帕亚亚姆的儿子，曾在二代登场，是一名年轻的海盗。地元素使卑弥是须佐之女，被“第三只眼”选中，具有预知未来的能力。斯派德和哈特是科技与军事强国兹亚帕兰的成员，为达目的而利用了穆特一行，而面具男艾斯则和他们一起行动。 在《失落的时代》和《漆黑的黎明》中，玩家取得船后剧情的推进顺序将不再单一，因为玩家可以周游世界并自由的访问沿海的城镇与村庄。

在远古的维亚德，盛行于世的炼金术极大推动了文明的发展，但是最后，带给世界战乱的炼金术随着尘封而逐渐消失。开启炼金术封印的4颗元素之星藏在在阿尔法山的神殿中，由海迪亚村民世世代代的守护着。在《开启的封印》中，年轻的海迪亚炼金术士罗宾和杰拉德进入阿尔法山进行探索，然而三颗元素之星却被萨帝罗斯、梅娜蒂、加西亚和阿历克斯一行夺走。在追逐萨帝罗斯点燃水星灯塔期间，另两位年轻的炼金术士伊万和米雅莉加入队伍，然而罗宾一行却仍没能阻止萨帝罗斯用点燃第一座灯塔。在漫长的追逐后，罗宾一行和萨帝罗斯等人在金星灯塔再次展开了战斗，萨帝罗斯和梅娜蒂为恢复力量而把金星之星投进了灯塔，却依然被罗宾杀掉。然而加西亚和阿历克斯却依然在继续寻找剩下的两座灯塔。

在《失落的时代》中，玩家将控制加西亚，并继续完成既定的任务——点燃剩下的两座灯塔，让强大的炼金术之力重回维亚德。在罗宾一行寻找加西亚的同时，加西亚一行也乘坐着新伙伴皮卡德的船扬帆起航。了解到如不让炼金术回归，世界将会面临消亡之后，加西亚便动身前去点燃木星灯塔。而当罗宾也追到木星灯塔上时，却中复仇心切的火元素使阿加迪奥和喀斯特的陷阱，加西亚帮助罗宾战胜了两名复仇者。在争议解决后，加西亚和罗宾会合并北方的火星灯塔进发；但是当加西亚到达火星灯塔塔顶时，贤者出现并警告队伍，若让人类拥有了如此强大的力量，世界将会被人类自己毁灭。当明白罗宾执意要点燃灯塔后，贤者便召唤出来一条三头龙来作为最后的筹码。当队伍杀败三头龙并点燃火星灯塔点燃后，炼金术再度回到了维亚德，并聚集于阿尔法山上。而利用了其他人的阿历克斯只需站在阿尔法顶就能接受巨大的力量，然而正如贤者所料，阿历克斯随着坍塌的阿尔法山一起下沉了。

《漆黑的黎明》发生于《失落的时代》结局后的三十年。随着罗宾一行把黄金太阳之力重新带回了维亚德，大陆发生漂移，新的国家和物种诞生。然而，能吸取大自然和炼金术士精神力的精神力黑洞却出现在维亚德各处。特里意外的弄坏了伊万发明的滑翔翼，因而罗宾决定让他和穆特、卡莉丝一起到神鸟的岩山寻找修复材料——洛克鸟的羽毛。在途中他们遇到了反派斯派德、哈特和艾斯。穆特来到了兽人居住的摩尔格尔地区后就获得了洛克鸟的羽毛，同时他们也被骗启动了造成“被诅咒的日蚀”的露娜灯塔，而覆盖大半块大陆的日蚀之阴影带来了痛苦与死亡。为了终结日蚀，穆特等人击败了斯派德和哈特，并启动能增强炼金术机器输出的光之增幅机——阿波罗。在启动了阿波罗，终结被诅咒的日蚀之后，一行人各自回到了家乡。然而，迎接穆特的却是一个异常巨大的精神力黑洞。